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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Meio Ambiente. |
Data corrente: |
18/12/2017 |
Data da última atualização: |
12/03/2018 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
LACERDA JÚNIOR, G. V.; NORONHA, M. F.; SOUSA, S. T. P. de; CABRAL, L.; DOMINGOS, D. F.; SÁBER, M. L.; MELO, I. S. de; OLIVEIRA, V. M. |
Afiliação: |
GILENO VIEIRA LACERDA JÚNIOR, CPQBA-UNICAMP; MELLINE FONTES NORONHA, CPQBA-UNICAMP; SANDERSON TARCISO PEREIRA DE SOUSA, CPQBA-UNCIAMP; LUCELIA CABRAL, CPQBA-UNICAMP; DANIELA F DOMINGOS, University of California San Diego; MIRIAN L SABER; ITAMAR SOARES DE MELO, CNPMA; VALERIA MAIA OLIVEIRA, CPQBA. |
Título: |
Potential of semiarid soil from Caatinga biome as a novel source for mining lignocellulose-degrading enzymes. |
Ano de publicação: |
2017 |
Fonte/Imprenta: |
FEMS Microbiology Ecology, v. 93, n. 2, p. 1-15, 2017. |
DOI: |
https://doi.org/10.1093/femsec/fiw248 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
The litterfall is the major organic material deposited in soil of Brazilian Caatinga biome, thus providing the ideal conditions for plant biomass-degrading microorganisms to thrive. Herein, the phylogenetic composition and lignocellulose-degrading capacity have been explored for the first time from a fosmid library dataset of Caatinga soil by sequence-based screening. A complex bacterial community dominated by Proteobacteria and Actinobacteria was unraveled. SEED subsystems-based annotations revealed a broad range of genes assigned to carbohydrate and aromatic compounds metabolism, indicating microbial ability to utilize plant-derived material. CAZy-based annotation identified 7275 genes encoding 37 glycoside hydrolases (GHs) families related to hydrolysis of cellulose, hemicellulose, oligosaccharides and other lignin-modifying enzymes. Taxonomic affiliation of genes showed high genetic potential of the phylum Acidobacteria for hemicellulose degradation, whereas Actinobacteria members appear to play an important role in celullose hydrolysis. Additionally, comparative analyses revealed greater GHs profile similarity among soils as compared to the digestive tract of animals capable of digesting plant biomass, particularly in the hemicellulases content. Combined results suggest a complex synergistic interaction of community members required for biomass degradation into fermentable sugars. This large repertoire of lignocellulolytic enzymes opens perspectives for mining potential candidates of biochemical catalysts for biofuels production from renewable resources and other environmental applications. MenosThe litterfall is the major organic material deposited in soil of Brazilian Caatinga biome, thus providing the ideal conditions for plant biomass-degrading microorganisms to thrive. Herein, the phylogenetic composition and lignocellulose-degrading capacity have been explored for the first time from a fosmid library dataset of Caatinga soil by sequence-based screening. A complex bacterial community dominated by Proteobacteria and Actinobacteria was unraveled. SEED subsystems-based annotations revealed a broad range of genes assigned to carbohydrate and aromatic compounds metabolism, indicating microbial ability to utilize plant-derived material. CAZy-based annotation identified 7275 genes encoding 37 glycoside hydrolases (GHs) families related to hydrolysis of cellulose, hemicellulose, oligosaccharides and other lignin-modifying enzymes. Taxonomic affiliation of genes showed high genetic potential of the phylum Acidobacteria for hemicellulose degradation, whereas Actinobacteria members appear to play an important role in celullose hydrolysis. Additionally, comparative analyses revealed greater GHs profile similarity among soils as compared to the digestive tract of animals capable of digesting plant biomass, particularly in the hemicellulases content. Combined results suggest a complex synergistic interaction of community members required for biomass degradation into fermentable sugars. This large repertoire of lignocellulolytic enzymes opens perspectives for mining potential... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Caatinga soils; Lignocellulose degradation. |
Thesagro: |
Bactéria; Biocombustível; Biodegradação; Caatinga; Solo. |
Thesaurus Nal: |
Lignocellulose; Metagenomics; Semiarid soils. |
Categoria do assunto: |
S Ciências Biológicas |
Marc: |
LEADER 02619naa a2200337 a 4500 001 2082786 005 2018-03-12 008 2017 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $ahttps://doi.org/10.1093/femsec/fiw248$2DOI 100 1 $aLACERDA JÚNIOR, G. V. 245 $aPotential of semiarid soil from Caatinga biome as a novel source for mining lignocellulose-degrading enzymes.$h[electronic resource] 260 $c2017 520 $aThe litterfall is the major organic material deposited in soil of Brazilian Caatinga biome, thus providing the ideal conditions for plant biomass-degrading microorganisms to thrive. Herein, the phylogenetic composition and lignocellulose-degrading capacity have been explored for the first time from a fosmid library dataset of Caatinga soil by sequence-based screening. A complex bacterial community dominated by Proteobacteria and Actinobacteria was unraveled. SEED subsystems-based annotations revealed a broad range of genes assigned to carbohydrate and aromatic compounds metabolism, indicating microbial ability to utilize plant-derived material. CAZy-based annotation identified 7275 genes encoding 37 glycoside hydrolases (GHs) families related to hydrolysis of cellulose, hemicellulose, oligosaccharides and other lignin-modifying enzymes. Taxonomic affiliation of genes showed high genetic potential of the phylum Acidobacteria for hemicellulose degradation, whereas Actinobacteria members appear to play an important role in celullose hydrolysis. Additionally, comparative analyses revealed greater GHs profile similarity among soils as compared to the digestive tract of animals capable of digesting plant biomass, particularly in the hemicellulases content. Combined results suggest a complex synergistic interaction of community members required for biomass degradation into fermentable sugars. This large repertoire of lignocellulolytic enzymes opens perspectives for mining potential candidates of biochemical catalysts for biofuels production from renewable resources and other environmental applications. 650 $aLignocellulose 650 $aMetagenomics 650 $aSemiarid soils 650 $aBactéria 650 $aBiocombustível 650 $aBiodegradação 650 $aCaatinga 650 $aSolo 653 $aCaatinga soils 653 $aLignocellulose degradation 700 1 $aNORONHA, M. F. 700 1 $aSOUSA, S. T. P. de 700 1 $aCABRAL, L. 700 1 $aDOMINGOS, D. F. 700 1 $aSÁBER, M. L. 700 1 $aMELO, I. S. de 700 1 $aOLIVEIRA, V. M. 773 $tFEMS Microbiology Ecology$gv. 93, n. 2, p. 1-15, 2017.
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Registro original: |
Embrapa Meio Ambiente (CNPMA) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
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Registro Completo
Biblioteca(s): |
Embrapa Gado de Leite. |
Data corrente: |
04/01/2012 |
Data da última atualização: |
23/01/2023 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Circulação/Nível: |
B - 1 |
Autoria: |
SANTOS, M. E. R.; FONSECA, D. M. da; GOMES, V. M.; GOMIDE, C. A. de M.; NASCIMENTO JÚNIOR, D. do; QUEIROZ, D. S. |
Afiliação: |
MANOEL EDUARDO ROZALINO SANTOS, UFV; DILERMANDO MIRANDA DA FONSECA, UFV; VIRGÍLIO MESQUITA GOMES, UFV; FAPEMIG; CARLOS AUGUSTO DE MIRANDA GOMIDE, CNPGL; DOMÍCIO DO NASCIMENTO JÚNIOR, UFV; DOMINGOS SÁVIO QUEIROZ, EPAMIG. |
Título: |
Capim-braquiária sob lotação contínua e com altura única ou variável durante as estações do ano: morfogênese e dinâmica de tecidos. |
Ano de publicação: |
2011 |
Fonte/Imprenta: |
Revista Brasileira de Zootecnia, v. 40, n. 11, p. 2323-2331, 2011. |
DOI: |
https://doi.org/10.1590/S1516-35982011001100007 |
Idioma: |
Português |
Conteúdo: |
Este trabalho foi realizado com o objetivo de identificar estratégias eficazes de manejo do pastejo de Brachiaria decumbens cv. Basilisk, sob lotação contínua, com base em avaliações das suas características morfogênicas e estruturais. Duas estratégias de manejo do pastejo foram estudadas: em uma, o pasto foi mantido com 25 cm de altura média durante todo o período experimental e, na outra, foi mantido em 15 cm de altura média durante o inverno, com aumento para 25 cm a partir do início da primavera. Adotou-se o delineamento de blocos casualizados em esquema de parcelas subdivididas com quatro repetições. Consideraram-se, como fator primário, as estratégias de manejo do pastejo, caracterizadas pelas alturas médias dos pastos durante as estações do ano (inverno, primavera e verão), e, como fator secundário, as estações. O rebaixamento do pasto para 15 cm no inverno resultou em maior taxa de aparecimento foliar (0,02 folha/perfilho.dia) e maior número de folhas vivas (4,5 folhas por perfilho) no inverno, mas provocou redução, no inverno, da duração de vida da folha (66 dias), da taxa de senescência foliar (0,22 cm/perfilho.dia) e dos comprimentos da lâmina foliar (11 cm) e pseudocolmo (15,2 cm) em relação ao pasto com 25 cm. Nesta estação, foram menores os valores observados para as taxas de aparecimento foliar (0,06 folha/perfilho.dia), alongamento foliar (0,110 cm/perfilho.dia) e alongamento de pseudocolmo (0,008 cm/perfilho.dia), número de folha viva (2,9 folhas por perfilho) e comprimentos da lâmina foliar (8,6 cm) e do pseudocolmo (13,5 cm). Por outro lado, a duração de vida da folha (139 dias) e o número de folhas mortas (2,0 folhas por perfilho) foram maiores. O maior valor de taxa de senescência foliar ocorreu na primavera (0,40 cm/perfilho.dia). O pasto de B. decumbens cv. Basilisk sob lotação contínua pode ser manejado de forma sazonal, com rebaixamento para 15 cm no início do inverno e posterior aumento para 25 cm no início da primavera. MenosEste trabalho foi realizado com o objetivo de identificar estratégias eficazes de manejo do pastejo de Brachiaria decumbens cv. Basilisk, sob lotação contínua, com base em avaliações das suas características morfogênicas e estruturais. Duas estratégias de manejo do pastejo foram estudadas: em uma, o pasto foi mantido com 25 cm de altura média durante todo o período experimental e, na outra, foi mantido em 15 cm de altura média durante o inverno, com aumento para 25 cm a partir do início da primavera. Adotou-se o delineamento de blocos casualizados em esquema de parcelas subdivididas com quatro repetições. Consideraram-se, como fator primário, as estratégias de manejo do pastejo, caracterizadas pelas alturas médias dos pastos durante as estações do ano (inverno, primavera e verão), e, como fator secundário, as estações. O rebaixamento do pasto para 15 cm no inverno resultou em maior taxa de aparecimento foliar (0,02 folha/perfilho.dia) e maior número de folhas vivas (4,5 folhas por perfilho) no inverno, mas provocou redução, no inverno, da duração de vida da folha (66 dias), da taxa de senescência foliar (0,22 cm/perfilho.dia) e dos comprimentos da lâmina foliar (11 cm) e pseudocolmo (15,2 cm) em relação ao pasto com 25 cm. Nesta estação, foram menores os valores observados para as taxas de aparecimento foliar (0,06 folha/perfilho.dia), alongamento foliar (0,110 cm/perfilho.dia) e alongamento de pseudocolmo (0,008 cm/perfilho.dia), número de folha viva (2,9 folhas por perfilh... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Altura do pasto; Perfilho. |
Thesagro: |
Brachiaria Decumbens; Colmo; Folha; Pastejo. |
Categoria do assunto: |
F Plantas e Produtos de Origem Vegetal |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/51704/1/Artigo-meta-2011-RevBZ-Gomide.pdf
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Marc: |
LEADER 02886naa a2200265 a 4500 001 1911662 005 2023-01-23 008 2011 bl uuuu u00u1 u #d 024 7 $ahttps://doi.org/10.1590/S1516-35982011001100007$2DOI 100 1 $aSANTOS, M. E. R. 245 $aCapim-braquiária sob lotação contínua e com altura única ou variável durante as estações do ano$bmorfogênese e dinâmica de tecidos.$h[electronic resource] 260 $c2011 520 $aEste trabalho foi realizado com o objetivo de identificar estratégias eficazes de manejo do pastejo de Brachiaria decumbens cv. Basilisk, sob lotação contínua, com base em avaliações das suas características morfogênicas e estruturais. Duas estratégias de manejo do pastejo foram estudadas: em uma, o pasto foi mantido com 25 cm de altura média durante todo o período experimental e, na outra, foi mantido em 15 cm de altura média durante o inverno, com aumento para 25 cm a partir do início da primavera. Adotou-se o delineamento de blocos casualizados em esquema de parcelas subdivididas com quatro repetições. Consideraram-se, como fator primário, as estratégias de manejo do pastejo, caracterizadas pelas alturas médias dos pastos durante as estações do ano (inverno, primavera e verão), e, como fator secundário, as estações. O rebaixamento do pasto para 15 cm no inverno resultou em maior taxa de aparecimento foliar (0,02 folha/perfilho.dia) e maior número de folhas vivas (4,5 folhas por perfilho) no inverno, mas provocou redução, no inverno, da duração de vida da folha (66 dias), da taxa de senescência foliar (0,22 cm/perfilho.dia) e dos comprimentos da lâmina foliar (11 cm) e pseudocolmo (15,2 cm) em relação ao pasto com 25 cm. Nesta estação, foram menores os valores observados para as taxas de aparecimento foliar (0,06 folha/perfilho.dia), alongamento foliar (0,110 cm/perfilho.dia) e alongamento de pseudocolmo (0,008 cm/perfilho.dia), número de folha viva (2,9 folhas por perfilho) e comprimentos da lâmina foliar (8,6 cm) e do pseudocolmo (13,5 cm). Por outro lado, a duração de vida da folha (139 dias) e o número de folhas mortas (2,0 folhas por perfilho) foram maiores. O maior valor de taxa de senescência foliar ocorreu na primavera (0,40 cm/perfilho.dia). O pasto de B. decumbens cv. Basilisk sob lotação contínua pode ser manejado de forma sazonal, com rebaixamento para 15 cm no início do inverno e posterior aumento para 25 cm no início da primavera. 650 $aBrachiaria Decumbens 650 $aColmo 650 $aFolha 650 $aPastejo 653 $aAltura do pasto 653 $aPerfilho 700 1 $aFONSECA, D. M. da 700 1 $aGOMES, V. M. 700 1 $aGOMIDE, C. A. de M. 700 1 $aNASCIMENTO JÚNIOR, D. do 700 1 $aQUEIROZ, D. S. 773 $tRevista Brasileira de Zootecnia$gv. 40, n. 11, p. 2323-2331, 2011.
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Esconder MarcMostrar Marc Completo |
Registro original: |
Embrapa Gado de Leite (CNPGL) |
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